初めまして。勝手ですが個人の意見として書き込みます。
甘党さんに非はないのですね。それならやることは一つです。
Sくんに何で私をそんな風に悪くいうの？と質問するのです。
ポイントは「私は何もしてないのに」だと思いますのでそれを交えた質問を。
話すのも怖い、となればもう一つの方法で。
それは友達orクラスメイトの誰かにきいてみること。情報を漏らさない信頼のおける友人がいいです。
先生への相談だとSくんにばれやすいと思いますし、案外クラスの隅々まで理解できてない先生は多いので。(生徒思いの先生なら話は別ですよ！)
クラスの友人ならあなたとSくんを客観的にみつめているはずなので、何でこんな嫌なこと言ってくるんだろう... というような質問をすればもしかしたら何か発見があるかもしれません。
参考になれば嬉しいのですが、あくまでも方法の一例であるのでこれに縛られず柔軟に考えて。
今はつらくても、それがずっと続くなんてありえないんだから。